Le diagnostic bactériologique des mammites par PCR est-il fiable ?

Résumé

L’identification des pathogènes impliqués dans les mammites est souvent utile, que ce soit à des fins thérapeutiques ou épidémiologiques. La PCR quantitative (qPCR) en temps réel est maintenant proposée en lieu et place de la méthode de référence qui consiste à cultiver des bactéries sur gélose et à les identifier ensuite par différents tests. Le principe de la qPCR est décrit ainsi que les principales caractéristiques du Kit commercial PathoProof, actuellement le plus utilisé. La sensibilité et la spécificité de la qPCR utilisée sur des laits de quartier et de mélange sont rapportées à partir de la littérature. Les avantages et les inconvénients de la qPCR et de la méthode de référence sont comparés et discutés. Pour les laits individuels de quartiers, le résultat de la qPCR, mettant souvent en évidence plusieurs espèces bactériennes différentes en raison de sa très grande sensibilité peut poser des difficultés d’interprétation quand il s’agit d’identifier le pathogène responsable de la mammite. Utilisée sur le lait de tank, la qPCR peut faciliter la mise en évidence de pathogènes présentant un risque en santé publique ou à localisation uniquement intramammaire.

Abstract

The identification of pathogens which cause mastitis is often useful, whether it be for therapeutic or epidemiological purposes. Real-time quantitative PCR (qPCR) is now proposed instead of the reference method which involves growing bacteria on agar and then identifying them by using different tests. The qPCR method is described as well as the main characteristics of the most regularly used commercial kit, ‘PathoProof’. Literature values for sensitivity and specificity of the qPCR used to test milk from each quarter and bulk milk are given. The advantages and disadvantages of qPCR and the reference method are compared and discussed. qPCR results from milk from each quarter often indicate the presence of several bacterial species because of its high sensitivity. This can make interpretation difficult when trying to identify the pathogen responsible for mastitis. Used on bulk milk, qPCR can help in the detection of pathogens which are either a risk for public health or are only found in the mammary gland.