Méthanisation agricole et impact du retour au sol des digestats sur le devenir des populations de pathogènes zoonotiques

Résumé

La France connait un accroissement important du nombre de sites de méthanisation depuis une vingtaine d’année. La digestion anaérobie est un procédé de bioraffinerie environnementale pour la production d’énergie renouvelable et le digestat peut être valorisé en agriculture comme amendement et fertilisant organique. Les digestats peuvent potentiellement contenir des microorganismes pathogènes des humains et des animaux. Après épandage, leur devenir dépend de leurs caractéristiques intrinsèques et de nombreux facteurs extrinsèques comme les caractéristiques édaphiques (pH, texture, humidité, teneur en matière organique, diversité microbienne), les conditions climatiques et les caractéristiques de la parcelle. Ce sont l’ensemble de ces facteurs qui impactent le devenir des pathogènes après épandage et qui vont déterminer le délai nécessaire à leur abattement. Une approche systémique est ainsi nécessaire pour une meilleure compréhension des dynamiques des populations de microorganismes pathogènes.