H4DC : Un projet Européen pour appréhender la prévalence de Cryptosporidium et évaluer son impact économique dans les élevages laitiers

Résumé

La cryptosporidiose est une cause majeure de diarrhée et de mortalité chez le veau nouveau-né. L’agent étiologique de cette maladie est un protozoaire parasite appartenant au genre Cryptosporidium. Afin d’évaluer la prévalence, la diversité des espèces et des sous génotypes de ce parasite dans les élevages bovins laitiers, une étude a été menée conjointement entre la France, la Belgique et les Pays-Bas entre 2019 et 2022. Ce projet de recherche soutenu par le programme européen Interreg2 mers a montré que la prévalence moyenne du parasite était de 38% et variait peu sur la durée de l’étude et le pays considéré. L’espèce C. parvum a la prévalence la plus élevée (de 64.2% à 86.9% des échantillons analysés). Les espèces C. bovis et C. ryanae ont respectivement une prévalence de 16.6% et 5.6%. L’espèce C. andersoni n’a été retrouvée que chez des bovins adultes. Sur les 13 sous génotypes identifiés pour le marqueur GP60, le sous génotype IIaA15G2R1 a été le plus fréquent (détecté dans 46.7% à 94.4% des échantillons analysés). Plus particulièrement, ni la diversité des espèces ni celle des sous génotypes n’ont présenté de variations au cours du temps et sur les trois pays étudiés ce qui suggère que nous pourrions avoir une seule population unique et stable sur la zone considérée. En parallèle, l’analyse des données économiques collectées au niveau des élevages a permis d’appréhender l’impact financier des diarrhées chez les veaux. Ce coût global par ferme a diminué sur la période de l’étude. Il est passé en moyenne de 3141€ à 1558€ en Belgique, de 2129€ à 1323€ en France et de 2833€ à 1505€ aux Pays Bas. Rapporté à la prévalence de Cryptosporidium, le coût apparent de la cryptosporidiose par exploitation est passé de 1 286 € à 657€ en Belgique, 821€ à 326 € en France et de 1052€ à 752€ aux Pays Bas. Une étude de marché a aussi été menée pour comparer l’efficacité et les prix des kits de diagnostic incluant la détection de Cryptosporidium. Les seuils de sensibilité vont de 83% à 100% et les seuils de spécificité s’étendent de 87.5% à 100% pour des prix allant de 7 à 57 euros. Ce travail présente pour la première fois une étude longitudinale menée à grande échelle sur 3 pays européens associant à la fois des données épidémiologiques permettant d’interroger la structure de la population de Cryptosporidies couvrant la zone d’étude mais aussi l’impact économique de cette parasitose dans les élevages bovins laitiers.