La grippe équine : outils moléculaires et actualité épidémiologique.

Résumé

Le virus de la grippe équine est l’un des pathogènes respiratoires les plus importants chez le cheval. Nous présentons ici une comparaison de trois méthodes de diagnostic réalisées dans des conditions dites « terrain », un test immunochromatographique (Directigen Flu A - Becton Dickinson), une RT-PCR et une RT-PCR en temps réel afin de déterminer la technique la plus appropriée. Le second but de cette étude a été le typage des souches virales circulant en France. De novembre 2005 à juin 2006, 104 prélèvements nasaux de chevaux avec des symptômes grippaux ont été adressés au laboratoire Frank Duncombe. Un protocole de comparaison a été réalisé sur chaque échantillon. L’étude phylogénique a porté sur l’ensemble des gènes de la neuraminidase et de l’hémagglutinine. Le test DFA est plus adapté au diagnostic de routine, mais il est moins sensible que les deux autres méthodes puisqu’il ne détecte pas un quart des virus influenza. La RT-PCR en temps réel est la méthode la plus sensible, et peut être une bonne alternative au test rapide. Les résultats de l’étude phylogénique révèlent que les souches circulant en France appartiennent au lignage américain, sous-lignage floridien comme les récentes souches italiennes et les virus influenza canins de sous-type H3N8.