Microbiotes respiratoires des jeunes bovins et broncho-pneumonies infectieuses : état des connaissances

Résumé

Les microbiotes respiratoires des bovins ne sont étudiés que depuis très peu de temps, principalement chez les veaux et les jeunes bovins qu’ils soient cliniquement sains ou atteints de bronchopneumonies infectieuses (BPI). Les principaux résultats montrent une diversité taxonomique bactérienne beaucoup plus importante dans les cavités nasales que dans l’appareil respiratoire profond. La composition en bactéries (embranchements, genres) du microbiote diffère selon la localisation du prélèvement et évolue aussi dans le temps en fonction de l’environnement et des différents contextes d’élevage. En l’état des connaissances, il pourrait exister des communautés bactériennes statistiquement associées à la présence ou l’absence (Lactobacillaceae et Bacillaceae) de BPI mais les biais méthodologiques possibles et les résultats divergents entre les études incitent à la prudence et à des investigations supplémentaires.

Abstract

Investigations into respiratory microbiota in cattle have only recently been started, and the studies have mainly involved calves and young animals either clinically healthy or infected with infectious bronchopneumonia (IBP). The main results show a much greater bacterial taxonomic diversity in the nasal cavities than in the deep respiratory tract. This taxonomic diversity is even more important in sick calves. The bacterial composition (branches, genera) of the microbiota differs according to the location of the sampling and also changes over time depending on the environment and the rearing system. Current knowledge implies that there may be bacterial communities statistically associated with the presence or absence of Lactobacillaceae and Bacillaceae, but possible methodological biases and conflicting results between studies encourage caution and additional investigations.