Recherche de pathogènes respiratoires bovins par PCR temps réel multiplexe

Résumé

Les outils de biologie moléculaire sont utilisés en routine depuis janvier 2010 au Laboratoire départemental d’analyses de Saône-et- Loire pour la recherche de six à sept agents pathogènes majeurs impliqués dans les troubles respiratoires du jeune bovin de moins d’un an. La technique de PCR en temps réel a rapidement remplacé les méthodes classiques d’identification des virus et des bactéries en offrant un diagnostic plus sensible, spécifique, rapide et simultané multiagents. Des interrogations demeurent toutefois quant à l’interprétation diagnostique d’un résultat positif obtenu sur écouvillon nasal profond (ENP) pour des bactéries naturellement présentes dans le nasopharynx, comme les pasteurellacées. Une étude a alors été menée, en collaboration avec la société Zoetis, pour déterminer la nature des agents pathogènes détectables par PCR sur ENP de veaux cliniquement sains. La prévalence élevée d’ENP trouvés positifs en hiver pour Pasteurella multocida sur veaux sains nous conduit à émettre des réserves sur son implication dans les bronchopneumonies infectieuses sur la seule base d’un résultat positif en PCR pour un prélèvement des voies respiratoires supérieures.

Abstract

Molecular biology tools have been used routinely since January 2010 in the Saône-et-Loire departmental laboratory for the diagnosis of six to seven major pathogens involved in acute respiratory diseases of young cattle. Real-time PCR rapidly replaced the conventional techniques for identifying viruses and bacteria by providing a faster, more sensitive, more specific multi-agent diagnosis. However, questions remain concerning the diagnostic interpretation of a positive result obtained from a deep nasopharyngeal swab (NS) for naturally occurring bacteria of the oropharynx such as Pasteurellaceae. A study was therefore conducted in collaboration with the veterinary pharmaceutical company Zoetis to determine the type of pathogens detectable by PCR on NS taken during the winter from clinically healthy calves. NS samples were found to be positive for Pasteurella multocida. Therefore, the involvement of this pathogen in broncho-pneumonia is questionable when it is based solely on a positive PCR result obtained from a NS sample.