Comprendre et mobiliser le levier génétique pour la maitrise de la paratuberculose chez les bovins laitiers en race Holstein et Normande

Résumé

La paratuberculose représente un enjeu sanitaire et financier majeur pour la filière bovine. Dans le cadre de travaux de recherche mobilisant un grand nombre d’acteurs de recherche et de terrain français, ont été développés des indicateurs génomiques de résistance à cette maladie, qui sont désormais disponibles pour la race Prim’Holstein et la race Normande. Les données issues de ce projet, combinées à de nouvelles sérologies recueillies par les GDS du Grand Ouest, ont permis de constituer une population de référence suffisamment grande pour réaliser une évaluation génomique pilote relativement précise de la résistance à la paratuberculose en race Holstein (R² = 0.55 dans une population de validation ; Sanchez et al., 2022), puis en race Normande (R² = 0.50 dans une population de validation). Cette évaluation génomique, réalisée via l’approche dite « Single Step », permet, depuis 2022 en race Holstein et depuis 2024 en race Normande, de calculer en routine des index génomiques de la résistance à la paratuberculose (le phénotype étant sérologie positive vs sérologie négative), traduits en indicateurs génomiques : très sensible, sensible, standard, résistant. Ainsi, une vache Prim’holstein exposée à l’infection qui a un index de 1 (résistante) a deux fois moins de risque de développer une réponse positive en sérologie qu’une vache avec un index de 0 (standard). A l’inverse une vache Holstein avec un index de -1 exposée à l’infection a un risque multiplié par 3 de développer une réponse sérologique positive. En race Normande, ces effets estimés sont marqués mais un peu moins forts, sans doute du fait d’une précision un peu plus faible. Ils permettent l’identification des animaux résistants dès la naissance, de piloter les accouplements et ainsi de contribuer à l’amélioration de la gestion de la paratuberculose au sein des troupeaux exposés. Cette présentation vise à expliquer la méthodologie mise en oeuvre afin d’aboutir à ces index et la façon de les interpréter et les prendre en compte.