Diagnostic bactériologique des mammites au laboratoire Partie 2 : diagnostic par PCR

Résumé

Les PCR multiplexes pour le diagnostic étiologique des mammites sont disponibles depuis 10 ans ; plusieurs kits regroupant un nombre variable de valences existent. Les limites de détection performantes des PCR permettent d’obtenir des sensibilités relatives plus élevées que celles de la culture bactérienne. La sensibilité dépend cependant des kits, des seuils de Ct retenus et des cibles bactériennes (forte sensibilité pour S. aureus en particulier). Les autres avantages sont la rapidité, la spécificité analytique, l’insensibilité de la réaction à la présence de facteurs bactériostatiques inflammatoires ou antibiotiques, et la détection de gènes d’antibiorésistance ou de pathogénicité (dans le futur). Les limites des PCR multiplexes comprennent l’identification partielle des contaminations et l’interprétation délicate des multipositivités. Les PCR apparaissent comme complémentaires de la culture. Elles sont généralement utilisées sur des laits individuels, en seconde intention.

Abstract

Part 2: Diagnosis by PCR. Multiplex PCRs for the aetiological diagnosis of mastitis have been available for 10 years. Several kits exist which contain a variable number of valences. The effective detection limits of the PCRs make it possible to obtain higher relative sensitivities than those found by bacterial culture. However, the sensitivity depends on the kits used, Ct thresholds and bacterial targets (high sensitivity for S. aureus in particular). Other advantages are speed, analytical specificity, insensitivity of the reaction to the presence of inflammatory or antibiotic bacteriostatic factors, and detection of antibiotic resistance or pathogenicity genes (in the future). The limits of multiplex PCRs include the partial identification of contaminates and the delicate interpretation of multi-positive results. PCRs appear to be complementary to bacterial culture and they are generally used on individual milk samples as a second test.