Diagnostic bactériologique des mammites bovines au laboratoire. Partie 1 : diagnostic par culture bactérienne

Résumé

Les outils disponibles au laboratoire pour le diagnostic bactériologique des mammites reposent tout d’abord sur la culture et l’identification bactériennes, puis sur les PCR. Les premières méthodes n’ont pas été détrônées par les PCR car la grande majorité des agents de mammite en France sont des germes non spécifiques dont la culture, sur un ensemble de milieux complémentaires, est aisée et informative. De plus, l’identification a significativement progressé ces dernières années avec le développement et la disponibilité pour les laboratoires des bases de données bactériennes de la technologie MALDI-TOF. Cette spectrométrie de masse appliquée à l’identification des micro-organismes selon leur profil protéique permet une détermination rapide, précise et peu coûteuse de l’espèce. Elle ouvre des perspectives pour la caractérisation des isolats. Ainsi le point-clef reste la sensibilité de l’isolement. Les diverses façons de l’améliorer sont passées en revue : augmentation du volume de l’inoculum, enrichissement, optimisation de l’incubation, etc.

Abstract

Part 1: diagnosis by bacterial culture. The tools available in the laboratory for the bacteriological diagnosis of mastitis rely initially on bacterial culture and identification and then on PCR. The former methods were not replaced by PCR because the vast majority of mastitis agents in France are caused by non-specific germs. The culture of these germs on a set of complementary media is easy and informative. In addition, bacterial identification has been significantly improved in recent years with the development of bacterial databases using MALDI-TOF technology. This methodology which uses mass spectrometry to identify microorganism species, according to their protein profile, is fast, precise and inexpensive. It opens-up perspectives for the characterization of isolates. Therefore, the key point remains the sensitivity of isolation. The various ways to improve it are reviewed: increasing the volume of the inoculum, enrichment, optimization of incubation, etc.