Utilisation combinée d’analyses de mélanges réalisées sur des prélévements industriels et d’environnement pour déterminer le niveau d’infection de troupeaux laitiers vis-à-vis de l’infection par Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (MAP)

Résumé

Deux études successives, visant au final à proposer une méthode pour classer les troupeaux bovins lai- tiers vis à vis de l’infection par la paratuberculose, ont été conduites depuis 2007. La première menée sur 55 troupeaux a permis (i) de déterminer la valeur informative de différentes analyses (sérologie et cul- ture suivie de PCR) réalisées sur des mélanges de 5 animaux stratifiés selon la parité et sur des prélèvements d’environnement (ii) de proposer des combinaisons d’analyse d’intérêt dans le but de classer les troupeaux. La seconde, réalisée sur 283 troupeaux classés selon 3 niveaux de prévalence (A , B et C), a permis de calculer les sensibilités et spécificités et l’index de Youden, (index combiné dont la formule est Y = Se + Sp,1 qui permet d’évaluer la capacité diagnostique de l’outil concerné) de différents tests de mélange utilisés seuls ou en combinaisons. La combinaison la plus intéressante pour discriminer les cheptels A (séroprévalence nulle) des autres est l’association PCR sur des prélèvements d’environne- ment récoltés sur l’aire d’exercice et dans la salle de traite (Y=0,49) et celle qui discrimine le mieux les C (séroprévalence > 8 %) des autres est une association de la PCR sur l’aire d’exercice et les fèces des vaches en première lactation (Y= 0,44). Ces résultats laissent entrevoir la possibilité de classer correctement et à coût très faible les cheptels selon le risque de détenir ou non des animaux excréteurs de MAP pour organiser les échanges d’animaux en limitant le risque de transmettre l’infection aux trou- peaux acheteurs.